Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.6Q85ZW5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms