Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Npm2Q80W85 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Npm2Q80W85 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Npm2Q80W85 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Npm2Q80W85 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Npm2Q80W85 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Npm2Q80W85 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Npm2Q80W85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1125.3 ms