Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms