Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm29Q6PDI5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms