Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zbtb40Q6PCS8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms