Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms