Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggnbp1Q6K1E7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms