Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms