Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb6Q60692 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb6Q60692 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.5 ms