Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms