Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms