Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms