Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms