Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms