Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms