Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q08AU9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q08AU9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q08AU9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q08AU9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms