Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MitfQ08874 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms