Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.2 ms