Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfdn6Q03958 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms