Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms