Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl9P51670 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms