Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epb41P48193 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epb41P48193 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms