Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms