Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoP15409 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhoP15409 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhoP15409 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoP15409 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoP15409 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoP15409 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoP15409 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhoP15409 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhoP15409 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms