Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb3P09026 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms