Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01668 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01668 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01668 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01668 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01668 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01668 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01668 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01668 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms