Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabep1O35551 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabep1O35551 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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