Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms