Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8247F6VRJ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8247F6VRJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms