Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trappc8E9PWG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms