Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud3B1AZ99 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud3B1AZ99 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms