Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms