Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt71Q9R0H5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt71Q9R0H5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms