Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms