Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hmgn5Q9JL35 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgn5Q9JL35 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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