Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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