Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms