Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap29Q9ERB0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap29Q9ERB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap29Q9ERB0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap29Q9ERB0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap29Q9ERB0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap29Q9ERB0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap29Q9ERB0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms