Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc96Q9CR92 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 324.8 ms