Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms