Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms