Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Gps1Q99LD4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms