Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms