Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg4dQ8BGV9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms