Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb40Q6PCS8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms