Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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NipblQ6KCD5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NipblQ6KCD5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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