Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd2Q61285 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd2Q61285 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms