Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3c2aQ61194 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pik3c2aQ61194 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms