Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms