Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mdc1Q5PSV9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mdc1Q5PSV9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms